Élève du Conservatoire de Lausanne, Stéphane Mooser y étudie le cor auprès d’Olivier Alvarez, le cor naturel auprès d’Olivier Darbellay, ainsi que la direction d’orchestre auprès d’Hervé Klopfenstein. Il se perfectionne dans la classe de Bruno Schneider à la Hochschule für Musik de Freiburg im Breisgau.

Son parcours est jalonné de collaborations avec des ensembles prestigieux, tels que l’Orchestre de Chambre de Lausanne, le Berner Symphonie Orchester, l’Ensemble Contrechamps de Genève, Camerata Bern ou le Kammerorchester Basel.

Sa pratique des instruments historiques l’amène à se produire avec des formations de renom international, parmi lesquelles le Tafelmusik Baroque Orchestra de Toronto, le Bach Collegium Japan ou l’Australian Chamber Orchestra. Il participe chaque été aux "Jardins Musicaux" de Cernier (NE) en tant que premier cor de l'orchestre du festival.

Passionné de direction chorale, il a le bonheur de s'y consacrer depuis plusieurs années avec l'Ensemble vocal "Emocio".

Stéphane Mooser est membre de l’Orchestre de Chambre Fribourgeois et de la Geneva Camerata, et enseigne le cor et la culture musicale aux Conservatoires de Fribourg et Lausanne.